SPL基因是一种参与植物生长发育调节的植物特异性转录因子,已在木本植物中鉴定。
花芽分化过程影响开花和坐果的时间,调节植物生长,而SPL基因调控花朵发育的机制研究较少。但是在这项研究中,我们改变了这一现状。
由于植物转录因子是在转录水平上调节基因表达的DNA结合蛋白,因此对植物生长发育至关重要,而SQUAMOSA启动子结合蛋白样基因首先被鉴定为调节早期花发育的转录因子。
该基因家族也以78-80 bp氨基酸残基的保守DNA结合结构域命名,其特征在于两个DNA结合结构域和与锌指结构重叠的C端NLS核定位信号。
SPL基因家族已在几种栽培经济树中鉴定,例如荔枝,猕猴桃,板栗,柑橘,甜橙,苹果,葡萄,大枣,核桃,山核桃。
在这些植物当中,SPL基因广泛的参与了植物的生长过程,其中包括营养生长,花卉发育,果实发育和成熟以及非生物胁迫。
主要的SPL基因家族在植物花卉发育中具有重要作用,包括营养到生殖生长,花药发育,GA花调节途径和花形态发生。
比如在拟南芥中,AtSPL3及其同系物SPL4和SPL5在开花枝中高表达并参与开花,AtSPL3直接受SOC1基因调控。在SOC1和FUL的双重功能丧失突变体中,AtSPL4的转录本水平降低。
此外,AtSPL3、AtSPL4和AtSPL5参与调控的花体转变,需要与FT-FD模块协同作用,促进长日照下的花体分生组织转化。
另一方面,AtSPL9/AtSPL15和AtSPL13参与幼年到成虫的生长相,AtSPL9与叶片生长速率和最终大小有关。
但是在长日照条件下,除了在枝顶端起到类似作用外,DELLA和SPL之间的相互作用还干扰了SPL转录活性,从而通过灭活叶片中的miR172和枝顶端的MADS盒基因来延迟长日照条件下的花变。
除双子叶植物外,SPL基因在单子叶植物中也起了重要作用。在水稻中,OsSPL10优先在嫩穗和茎中表达,负性控制耐盐性,但积极控制毛状体形成,SPL14突变体增加花序分枝数和粒重,增加杆强度,OsSPL2、OsSPL17和OsSPL18调节分蘖数和株高。
不止如此,在其他木本植物中,SPL基因在花卉发育中也起着重要作用。GA可能间接影响其靶基因CmSPL6/CmSPL9/CmSPL16至miR156的表达,从而在板栗花蕾发育中发挥重要作用。
葡萄里的VpSBP11在从营养阶段向生殖阶段的过渡过程中起到转录因子的作用,拟南芥的过表达激活了FUL、AP1和LFY基因的表达。
从而显示出早期开花,CclSBP6和CclSBP7在柑橘中的过表达可以改变拟南芥的开花时间。
蓝莓作为一种对光周期敏感的浆果灌木,不仅日照短,还可以促进生殖生长。而蓝莓的花芽发育过程与开花和结果时间密切相关。
目前,温室栽培已成为我国北方蓝莓的重要方法,不仅可以保证蓝莓安全越冬,而且果实成熟后还能提前上市。
但是与露天蓝莓栽培相比,温室内蓝莓年生长周期特征差异显著,尤其在花芽分化方面。为了更好地研究蓝莓花芽发育的过程,我们利用基因组学对蓝莓中的SPL基因家族进行了全基因组分析。
我们以北方高丛蓝莓植物为原料,采集于北京市密云区蓝莓栽培园。在芽爆发时收集蓝莓的芽,叶,花芽和叶芽四种不同组,并且还选择来自VcSPL基因家族每个亚组的基因在不同组织中进行差异表达分析。
其次,为了进一步研究VcSPL在花诱导和启动中的作用,我们使用不同阶段收集的样品选择在花蕾、开花时花和花后受精后高表达的基因进行RT-qPCR。共选取蓝莓芽分化过程中的1个时期,详细描述不同时期的特征。
蓝莓、拟南芥、烟草、水稻、葡萄和越橘 SPL 蛋白的系统发育树。具有不同颜色的分支代表不同的子组。它们根据进化树分为6组,并用不同的颜色表示。
不同的图标代表不同物种的SPL基因,红色五角星代表蓝莓,绿色圆圈代表拟南芥,深蓝色圆圈代表烟草,青色圆圈代表水稻,浅蓝色三角形代表葡萄,黄色方块代表越橘。
在这项研究中,我们对蓝莓中的VcSPL进行了全基因组鉴定和分析。在系统发育树上共鉴定出56个VcSPL基因家族,分为56个亚科,并进一步通过基因结构域和基序分析支持结果。
除了VcSPL36外,40个VcSPL基因定位于细胞核,VcSPL35同时位于细胞质和细胞核中。
此外,对进化起源和顺式作用元件的分析为VcSPL基因家族的功能提供了进一步的见解,分段重复可能在VcSPL基因扩增中起关键作用。
通过表达谱和RT-qPCR的结果显示,VcSPL基因不仅具有空间和时间特异性,而且在蓝莓植株生长、叶片发育、花卉发育和非生物协迫中发挥重要作用,部分基因具有协同作用。
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